在格賓石籠結構中籠和地基之間的接觸問題十分重要，尤其當結構體處于流水之中，流水會導致石籠周圍土壤的流失，這種現象主要是由于石頭間有空隙，流水在這些空隙所形成的管道中產生局部加速度從而導致土壤的大量流失，少數情況下石籠結構會最終穩定下來，但多數情況下石籠結構會因此失去平衡，最終導致整個石籠結構潰塌。一般情況下，可采用如下2種方法防止這種現象發生。
           （1）在石籠和天然土層之間布置一道可透水的墊層。
           （2）減少通過石籠結構水流的流量和流速。

        在籠和天然土層之間布置一層可透水的墊層，如土工織等，對大多數格賓石籠結構來說都是十分有效的。但如果通過石籠結構體的水量很大的話，就有必要在結構中最薄弱的地方進行額外的保護。事實上從長遠來看，水流會破壞任何墊層，所以進行額外的保護就顯得尤為重要。在通常情況下，格賓石籠結構中需要額外保護的地方共有4處。（1）格賓石籠結構的兩端和填土之間的垂直接觸面。（2）圍堰的堰腳處。（3） 溢洪道兩邊邊墻的格賓石籠結構。（4）圍堰下游河道的消力池、消力坎。在這些地方要設置半透水或不透水的防滲帷幕來減少或阻止水流。半透水防滲帷幕可用土工織物制作，而不透水的防滲帷幕可用經過加工的格賓石籠結構。它的生產方法和一般的格賓石籠結構一樣，只不過是在填充塊石的過程中塊石之間的空隙都被混凝土填充。

        有時，即使采取了預防措施，也會發生上述破壞現象，這時，必須填充新的塊石或用新的格賓石籠代替已經破壞的石籠，并對其周圍的基礎進行修復處理。